在太一一行人告别(📒)数码(🐌)世界后，数码世界并(🛍)没有就此关闭朝向人类的大(🐉)门，而数码世(🗼)界的内部却没有太平多少时日(🌗)，就又(yòu )开(kāi )始了纷争(zhēng )(🐿)。
　　数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类(lèi )世界的和(🚑)平。太一、阿和、素(sù )娜等人都已先后成(chéng )为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们(men )一起并肩作战，只有阿(🙀)武和小(⛓)光成为了新(xīn )一代的领头人。被选中(zhōng )的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉(lì )绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音(yīn )）等人，和(🌼)他们一同战斗的除了(le )亚古兽、加布兽等，还有新(🔤)的数码宝贝参与。于是，在第一代(dài )数码人的带领下(🐖)，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……