在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就(jiù )此关闭朝向人类的大(🐉)门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又(yòu )开始了纷争。
　　数码世(👁)界急需一批被选中(zhōng )的孩子来维护数码世界和人(✖)类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先(🚣)后成为(wéi )了初中生(⏯)，没(méi )有太多(duō )精力和时间(jiān )能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武(🙉)和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩(hái )子有本宫大辅（木内玲子 配(🕯)音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配(👪)音）等人，和他们一同战斗的(🔈)除了亚(yà )古(🎥)兽、加布兽等，还有(📛)新的(👌)数(shù )码宝贝参与。于是，在第一代数(📐)码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……