20世紀末の現代、高校生の火(huǒ )野ヤマトは体育館で自分の名を呼ぶ巨大な「魔神」の幻(🐮)影を見る。幻を振り払おうとするヤマトであったが、「魔神」とともに「見知(🔲)らぬ女性」の(🐖)声が聞こえたとき、ヤマトは声(🖍)に歩み寄ってし(🐖)まう。 　 ヤマトが「魔神(shén )」によ(⏯)って運ばれた先は1万年前に(💻)地(🗞)殻変動で海に沈んだはずのムー大陸であった。訳が判(pàn )らないヤマトに対しムーの民たちは彼を「マジンガーが選(🗳)んだ救世(💝)主」と持ち上げる。彼(bǐ )らムー(🈸)の民の守護神こそ、彼を現代から過去に運ん(🔈)だゴッドマ(🐡)ジンガーであった。そんな折、ムーの(💸)民と拮抗する勢力であるドラゴ(🐖)ニアが襲来する(🌸)と、再び「魔神」の声がヤ(🎦)マトを呼び寄せる。ヤマトがゴッドマジンガーと融合したとき、ゴッドマジンガーはドラゴニアの恐竜軍団を撃退するのであった。