“闇之书事件”（参照魔法少女奈叶A's）的10年后。踏入19歳的高町奈叶、菲特·T·哈洛温、八神疾风三人，怀抱着(🔸)彼此的友情牵绊、为了追求各自的梦想实现而加入(📞)时空管理局，并以一流魔导师的身分活跃。
　　在此当中，出现了新发现的太古遗产“圣遗晶石”（レリック），以及以此为目标而(🙉)出现的谜样机械兵器“共(🧤)鸣拓发者”（ガジェットドローン）。为了迅速对应日后被称(chēng )为“圣遗晶石事件”的状况，八神疾风考虑到设(👪)置能够迅速对(duì )应的独立部队的必要(yào )性(xìng )，设立了(🤔)专责处理与太古遗(yí )产关连任(🔷)务的特殊(shū )部队——“机动六课”。
　　另一边，时(🏓)间回溯到四年前(😳)。昴(mǎo )·中(zhōng )岛在遭(🐂)到机(jī )场火灾卷入(🤼)而几乎丧命之际，由于奈叶的出(💁)现而得救。因为憧憬(jǐng )著如同“自己理(lǐ )想(xiǎng )中的(de )形象”一般的(💨)奈叶，昴在(🍾)当晚的满(mǎn )天星空之下(xià )，做出了“成为管理(lǐ )局的魔导师”的决定。
　　四年后，经过一番波折(shé )而顺利成为管理(lǐ )局的新进魔导师的昴(mǎo )，与训练校时代(🌮)的伙伴蒂雅娜·兰斯特共同(📛)挑(🏫)战魔导师的(🍏)升格试验。于远处凝视著两人考试的，分别是认定两人将成为“机动(🐊)六课”的明日之星而(ér )投以注意的疾风与菲特、还(hái )有奈叶。在三人的注视之中(Ⓜ)，随着宣告试验开始的ReinForce II（统御之力zwei）的声音，拉(lā )(🐞)开(🛳)了“StrikerS”故事的序幕。